全外顯子基因定序能否找出罕見神經肌肉疾病的成因?-罕見疾病

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全外顯子基因定序?


醫師您好,近期因為手腳無力,做了相關檢查卻找不出原因,就決定去做了全外顯子基因定序想請問以下的神經肌肉疾病,全外顯子基因定序找的到嗎?!1.小腦萎縮症2.亨丁頓舞蹈症3.SMA4.Charcot-Marie-Tooth 氏症5.GM1/GM2 Gangliosidosis6.Neuronal Ceroid Lipofuscinosis7.Hereditary spastic paraplegia8.甘迺迪氏症9.家族性澱粉樣多發性神經病變10.肌肉強直症11.三好氏遠端肌肉病變12.肌小管病變13.肢帶型肌失養症14. Emery-Dreifuss肌失養症15.GNE遠端肌病變這些是我從罕見疾病基金會找到的相關疾病不好意思有點多,還麻煩醫師幫我解答



匿名,20~29歲男性,詢問日期:2021/01/05

簡穎秀 醫師回覆-罕見疾病


您好:這些疾病的病因,不完全是現今的全外顯子技術可以找到的,此外,您做的全外顯子的涵蓋範圍等細節也需要請教您的醫師/報告,由您的臨床表現,各項檢查檢驗,配合全外顯子定序的技術細節才可能有較完整的了解。



回覆日期:2021/01/05

彙整補充說明


全外顯子基因定序(Whole Exome Sequencing, WES)是一種針對基因組中外顯子部分進行高通量測序的技術。
外顯子是指編碼蛋白質的基因片段,約佔人類基因組的1%至2%,但卻包含了大約85%的已知致病變異。
因此,這項技術在尋找遺傳性疾病的成因上具有相當的潛力。

針對您提到的這些神經肌肉疾病,WES能否找到其成因,主要取決於幾個因素:
1. 疾病的遺傳背景:許多神經肌肉疾病是由單一基因突變引起的,這些突變通常會在外顯子中出現。
因此,對於這些疾病,WES有可能找到相關的致病變異。
例如,亨丁頓舞蹈症(Huntington's disease)是由HTT基因的CAG重複擴增引起的,這種變異可以被WES檢測到。

2. 檢測的靈敏度和特異性:雖然WES能夠檢測到大多數外顯子中的變異,但對於某些特定的變異類型(如大型缺失或重排),其檢測能力可能有限。
此外,WES主要針對已知的基因變異,對於尚未被識別的變異或新突變的檢測能力也會受到限制。

3. 臨床表現與基因變異的關聯:即使WES檢測出變異,這些變異是否與您的臨床症狀相關也需要進一步的分析。
有些變異可能是良性的,並不會導致疾病。
因此,解讀基因檢測結果時,必須結合臨床表現和其他檢查結果。

4. 檢測的範圍:不同的基因檢測平台和套組可能涵蓋的基因範圍不同。
您提到的台大次世代基因檢測套組可能針對特定的神經肌肉疾病進行了優化,這可能會提高檢測的靈敏度和特異性。

針對您列舉的疾病,以下是一些簡單的分析:
- 小腦萎縮症:有多種遺傳型,部分可由WES檢測到。

- 亨丁頓舞蹈症:可由WES檢測到,因為其基因突變是已知的。

- 脊髓性肌萎縮症(SMA):通常由SMN1基因的缺失引起,WES能夠檢測到。

- Charcot-Marie-Tooth病:多數類型可由WES檢測到,因為涉及多個基因。

- GM1/GM2神經節苷脂症:這些疾病的基因突變也可由WES檢測到。

- 神經鞘脂沉積症(Neuronal Ceroid Lipofuscinosis):可由WES檢測到。

- 遺傳性痙攣性癱瘓:部分類型可由WES檢測到。

- 甘迺迪氏症:可由WES檢測到。

- 家族性澱粉樣多發性神經病變:部分基因可由WES檢測到。

- 肌肉強直症、三好氏遠端肌肉病變、肌小管病變、肢帶型肌失養症、Emery-Dreifuss肌失養症、GNE遠端肌病變:這些疾病的基因突變也可能被WES檢測到。

總結來說,全外顯子基因定序在尋找罕見神經肌肉疾病的成因上是有潛力的,但其結果的解讀需要專業醫師的協助,並且必須結合臨床症狀和其他檢查結果來進行全面的評估。
如果您對檢測結果有疑問,建議與您的醫師進一步討論,尋求更詳細的解釋和後續的檢查建議。

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